落叶无痕
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🍂_自动分牙数据_V1

发表于 分类于 Changyan：

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变更记录

版本号 作者 修订内容 发布日期
1.0.0 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 创建初始内容 2022-06-10
1.1.0 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 修改数据目录，增加数据数量 2022-06-15
1.2.0 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 增加数据链接，修改文档排版、数据样例 2022-06-16
1.2.1 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 修改数据样例描述 2022-06-16
1.3.1 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 修改数据数量，数据目录，命名规范，数据链接，数据样例。文档名称 2022-06-17
1.4.1 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 完善数据制作流程（增加图片），增加数据术语 2022-06-20
1.5.1 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 修改数据数量 2022-06-22
1.5.2 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 修改错误内容 2022-06-23
1.5.3 @sindre(sindre) 添加部分说明 2022-07-09
1.5.4 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 添加数据 2022-08-05
1.5.5 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 添加数据 2022-09-27
1.5.6 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 添加数据20份 2022-09-29
1.5.7 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 添加数据并修改数据数量 2022-10-14
1.6.7 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 修改数据内容，增加数据问题 2022-10-22
1.7.7 @邵巧钰(shaoqiaoyu) 添加数据及其描述 2023-02-20

1. 数据介绍

1.1 数据背景

  1. 数据来源于CAD
  2. 通过我司正畸软件（唐怀宽）版进行手工标注

1.2 应用场景

场景 场景应用
正畸 自动分牙
正畸 牙龈生成
CAD 全冠生成
CAD 牙齿识别

2. 数据概述

2.1 数据定位

  1. 主要用于牙齿分割

2.2 数据数量

分牙数据-已处理 1332份（缺少600717号下颌数据）特别数据-24份总计：1356份数据

2.3 命名规范

三个文件夹里的文件名一一对应

2.4 数据链接

http://192.168.1.55:9003/f/89412

2.5 数据目录

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
C:.
│  
├─source      #分牙模型
│      312580_上_0.ply
│      312580_下_1.ply
│      323645_上_2.ply
│      323645_下_3.ply
略
│      
├─target      #分牙标签
│      312580_上_0.npy
│      312580_下_1.npy
│      323645_上_2.npy
│      323645_下_3.npy
略
│      
└─test        #将标签映射到模型上
        312580_上_0.ply
        312580_下_1.ply
        323645_上_2.ply
        323645_下_3.ply

2.6 数据样例





2.7 数据制作流程










2.8 数据术语

术语 定义
正畸 矫正牙齿、解除错牙和畸形，美观牙齿。
牙位号（图）

3. 现阶段问题

数据问题：

@sindre(sindre)600717号下颌数据存在问题（上述数据中已删除该份下颌数据）
错误：分割标签与stl模型不匹配 （125864——>125863）现象：stl显示有125864面片，标签只有125863个，um显示有125863面片 （如图）可能原因： um转换成stl 多了个face解决方法： 用modeleditor重新将um导出stl后，面片数正常
修复后数据出现大量噪音，故删除600717号下颌数据

特别数据：

包含以下数据

  1. 测试组反馈效果不佳的数据：4份（上下颌）
  2. 筛选的牙龈多的数据：4份（上下颌）
  3. 正畸用于展会展示的数据（重度拥挤、少量间隙、牙列不齐、轻微覆盖）：4份（上下颌）

4. 未来计划

  1. 提高分牙数据格式的统一性

数据内容规范：

  1. 数据格式统一为LMDB，主要有以下原因：

    1. 有些服务器硬盘为机械硬盘，LMDB可映射内存，较少io影响。
    2. 数据小文件过多，存在传输过慢和丢失现象，而LMDB只有一个文件。
    3. 不同文件格式过多，如5颗牙分牙数据，16颗分牙数据，每次数据处理需要做大量判断，重复检查。

  2. 数据上下颌统一为如下格式，因为上下颌存在咬合关系不一定对，所以保留上下咬合关系没有用，如果用于排牙训练，只需把排好牙的数据打乱即可，而不用分牙数据替代。

  3. LMDB规范，一个mdb文件含有两个数据库，一个meta数据库，一个为data数据库，其中data数据库为（str,np.array)键值对类型，其中值通过msgpack.packb压缩成二进制。

    1. meta数据库：
      1. nb_samples：数据集大小（int)；
      2. description: 数据集描述（str）；
    2. data数据库：
      键值 描述 类型 形状
      name 数据原有名字
      data_source 数据来源
      mesh_vertices 这是三角网格中的顶点坐标信息，用于定义网格的形状和位置。
      mesh_faces 这是三角网格中的面片索引信息，用于连接顶点并定义网格的拓扑结构。网格面片索引
      vertex_labels 这是对牙弓牙齿每个顶点进行的标记或分类，可能用于区分不同类型的牙齿或其他目的。
      face_labels 这是对牙弓的每个面片进行的标记或分类，可能用于区分不同区域、组织或其他目的。
      tooth_len 这是牙弓中包含的牙齿数量，可以用于确定牙弓的大小和形状。
      jaw 这是指示牙弓所属的上下颌部位的属性，通过”upper”或”lower”来表示。
      unique_label 这是指牙弓中所有牙齿的唯一编号或标识符，确保每个牙齿都有一个独特的标记。
      vertex_normals 这是每个顶点的法线方向信息，用于计算光照和渲染效果。
      faces_normals 这是每个面片的法线方向信息，用于计算光照和渲染效果。
      vertex_mean_curvature 这是基于meshlab计算得出的每个顶点的平均曲率值，可用于分析网格形状的特征和曲率变化。

tools.pyDatasetToLmdb.py

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